これまでは、比較的眼に安全なレーザの話であったので、保護メガネの話が出てきませんでした。
しかし、クラス3Rの不可視光レーザでは、保護メガネが必要になってきます。
レーザ用の保護メガネは、あれば何でも良いと言うわけにはいきません。
ちゃんと、レーザの波長や光学濃度（レーザの透過率）を選定しなければなりません。
また、１つあれば十分と言うわけにもいきません。
作業に同時に立ち会う人数分用意しなければなりません。場合によっては見学者用の保護メガネも必要かもしれません。

良くあるのは、隣の部屋の保護メガネを借用してくるような使い方ですが、これも、NGです。保護メガネはレーザが設置してある場所ごとに用意しなければなりません。
危険を感じてから保護メガネを取りに行くのでは遅いのです。

また、同じ場所に3R以上の複数の波長のレーザがある場合は、レーザの波長ごとに保護メガネを用意することになります。（保護メガネによっては、2波長、3波長対応の保護メガネもあります。）

次に保護メガネの光学濃度ですが、不可視光レーザの場合は、レーザの波長を完全に遮断する完全吸収型タイプのものを選定します。光学濃度（OD）で5以上のものです。
レーザの波長によって保護眼鏡に色が付くことがあるので、特定の色が見えにくくなる場合があります。
調整作業に使用する波長変換カードまたはレーザガイド光の色や、警告ラベルやマニュアルなどの色を確認して、保護メガネをかけたままでも各々の色が見え、作業ができることを確かめる必要があります。

また、レーザ装置側にレーザウインド（YL-500）などで覆われていて、レーザが漏れてこない場合は、保護メガネを装着する必要はありません。しかし、覆いを外して作業する場合などは、保護メガネをかける必要があるので、必ず保護メガネは準備はしておかなければなりません。

保護メガネ以外には次のような対策が要求されています。

クラス3Rの不可視光レーザを使用する場合には、レーザ光が放出中であることを示す警報装置が必要になります。
厚生労働省の通達の中には「自動表示灯の警報装置を設けること。」が推奨されていますが、「レーザ照射中」と書いたプラカード（表示板）をレーザの部屋の前に掲げるだけでも問題ありません。

クラス3Rの不可視光レーザの光学系は、レーザの光路を可能な限り短くし、折れ曲がる回数を最小に減らし、可能な限り光路を遮へいすることが要求されています。
また、光学系は実験台や装置内にまとめ、レーザ光が装置を飛び出して、歩行路やその他の通路と交差しないようにしなければなりません。

「レーザ光路の末端は、適切な反射率と耐熱性を持つ拡散反射体又は吸収体とすること。」はクラス1M、2Mのレーザの光学系とほぼ同じですが、こちらはビーム径の大きさには関係なく、全てのクラス3Rの不可視光レーザの適応されます。

健康管理の面ではクラス3Rの不可視光レーザを使用する者及び、レーザ光にさらされる恐れのある作業をしている者は、視力検査に併せて前眼部（角膜、水晶体）検査を行うことが要求されています。
正確にレーザ光線による障害を特定するためには、レーザの作業に従事する前に検査しておく必要があるのですが、現実的にはなかなか厳しいと思います。
定期健診で、眼の検査を行いその変化を観察する方が現実的でしょう。